Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT12Q8IV01 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT12Q8IV01 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms