Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF554Q86TJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF554Q86TJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms