Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMC1Q7Z7K0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMC1Q7Z7K0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms