Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RD3Q7Z3Z2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms