Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NLRC3Q7RTR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRC3Q7RTR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms