Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYS1Q717R9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms