Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
USP43Q70EL4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP43Q70EL4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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