Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX8Q6ZV50 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX8Q6ZV50 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms