Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LINC00299Q6ZSB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms