Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms