Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms