Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNT2Q6UVM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT2Q6UVM3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.7 ms