Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCD3Q6STE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCD3Q6STE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms