Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L2Q6R6M4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L2Q6R6M4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L2Q6R6M4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms