Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EDC4Q6P2E9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EDC4Q6P2E9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
EDC4Q6P2E9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EDC4Q6P2E9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EDC4Q6P2E9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
EDC4Q6P2E9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
EDC4Q6P2E9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
EDC4Q6P2E9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
EDC4Q6P2E9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms