Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC42EP5Q6NZY7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms