Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY4

ZCCHC8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC8Q6NZY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC8Q6NZY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC8Q6NZY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC8Q6NZY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms