Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTN3Q6NUS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTN3Q6NUS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCTN3Q6NUS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCTN3Q6NUS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCTN3Q6NUS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCTN3Q6NUS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCTN3Q6NUS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCTN3Q6NUS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCTN3Q6NUS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms