Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC70Q6NSX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms