Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST2H2AA3Q6FI13 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms