Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MCTP1Q6DN14 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms