Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1LQ69YQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1LQ69YQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1LQ69YQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms