Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C9orf135Q5VTT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms