Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM164Q5U3C3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM164Q5U3C3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms