Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC1Q5TB30 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms