Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms