Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM201Q5SNT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms