Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXC2

MIIP, Migration and invasion-inhibitory protein, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIIPQ5JXC2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIIPQ5JXC2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIIPQ5JXC2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIIPQ5JXC2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms