Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITRM1Q5JRX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PITRM1Q5JRX3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms