Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms