Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL12Q53G59 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms