Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPAT3Q53EU6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPAT3Q53EU6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms