Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01620Q4KN68 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms