Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC153Q494R4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC153Q494R4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms