Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM12Q3MHD2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms