Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3H1Q32P28 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P3H1Q32P28 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3H1Q32P28 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P3H1Q32P28 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P3H1Q32P28 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P3H1Q32P28 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P3H1Q32P28 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P3H1Q32P28 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms