Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VMACQ2NL98 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VMACQ2NL98 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms