Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C17orf58Q2M2W7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C17orf58Q2M2W7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C17orf58Q2M2W7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C17orf58Q2M2W7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C17orf58Q2M2W7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C17orf58Q2M2W7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms