Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ISXQ2M1V0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISXQ2M1V0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISXQ2M1V0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms