Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MICAQ29983 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MICAQ29983 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MICAQ29983 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MICAQ29983 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms