Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FXNQ16595 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FXNQ16595 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FXNQ16595 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FXNQ16595 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FXNQ16595 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXNQ16595 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXNQ16595 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXNQ16595 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXNQ16595 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXNQ16595 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXNQ16595 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXNQ16595 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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FXNQ16595 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXNQ16595 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXNQ16595 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXNQ16595 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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FXNQ16595 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXNQ16595 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FXNQ16595 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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FXNQ16595 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXNQ16595 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXNQ16595 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXNQ16595 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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FXNQ16595 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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FXNQ16595 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXNQ16595 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXNQ16595 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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FXNQ16595 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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FXNQ16595 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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FXNQ16595 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXNQ16595 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXNQ16595 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXNQ16595 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXNQ16595 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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FXNQ16595 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXNQ16595 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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FXNQ16595 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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FXNQ16595 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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FXNQ16595 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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FXNQ16595 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXNQ16595 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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FXNQ16595 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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FXNQ16595 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FXNQ16595 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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