Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC2Q16515 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC2Q16515 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC2Q16515 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms