Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA3Q16281 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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