Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1Q15904 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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