Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USF2Q15853 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USF2Q15853 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USF2Q15853 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USF2Q15853 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USF2Q15853 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USF2Q15853 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USF2Q15853 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USF2Q15853 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USF2Q15853 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USF2Q15853 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USF2Q15853 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USF2Q15853 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USF2Q15853 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USF2Q15853 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USF2Q15853 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USF2Q15853 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USF2Q15853 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USF2Q15853 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USF2Q15853 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USF2Q15853 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USF2Q15853 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USF2Q15853 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USF2Q15853 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
USF2Q15853 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USF2Q15853 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USF2Q15853 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USF2Q15853 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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