Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP3Q15836 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms