Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP4Q15650 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP4Q15650 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms