Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A1Q15459 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A1Q15459 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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