Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SF3A2Q15428 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A2Q15428 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms