Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT31Q15323 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT31Q15323 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms